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这次军事会远没有一年前的那次紧张，但拖的时间更长，以至于大家又在乾清宫蹭吃了顿午饭。
由于大块玻璃的出现，科学院在陛下的提议下做了个玻璃大棚，在里面实验种植一些西洋人带来的植物和过季的蔬菜。
今天御厨出品就带有这样的色彩，也带着朱由检的目的。
菜式有土豆闷排骨、西红柿炒蛋、玉米羊骨汤、还有飘着红色辣椒的水煮牛肉、红烧羊肉、白切鸡、两样过季青菜等家常小菜，主食有米饭、面食、还有一篮子红色皮的疙瘩（红薯）摆在上面。
这几个菜一上桌，阁老徐光启都见过，有些还是他要求推广的，眼睛一亮，明白了皇帝的意思，也不多说，与内阁官员陪着皇帝坐着。
那毛文龙看着如此简单的伙食，他一直以为皇帝都是山珍海味的；至少来个鹿唇开胃，再来个熊掌垫底，最后来个鱼翅汤漱漱口，哪知是寻常物件；其实也不寻常，对于皇帝来说寻常而已。
他眼睛一红，扑通一下就跪在地上，大哭道：“陛下！臣参内宫总管曹化淳欺瞒陛下，贪污腐化，让陛下吃如此粗鄙的食物。”
边上正高兴招呼各位大臣就坐的曹化淳愣在哪里！根本就不知道怎么回事，旁边几个禁军武将知道毛文龙闯祸了，在那幸灾乐祸的捂着嘴憋着笑。
朱由检手里拿着根红薯，正准备就着红红的水煮牛肉下肚，听到这话也愣在哪里，疑惑的看着他。
王承恩出来将毛文龙扶起，轻声说道：“毛大人，这话从如何说起，大明皇家从太祖时起就是这样的菜单，只有宫廷宴席时才会上珍贵点的食材；你还别说珍贵，今天有几样你就不一定吃过！快去尝尝！”
朱由检这下明白过来了，原来是这么回事，你怕不知道那些御厨挑剔吧！
别看着简单，那羊肉是平常人吃的么！那水煮牛肉可是小黄牛最嫩的部位，一头牛的全在这里了，还嫌不够！朕都不敢说出去，怕被人打！
他看着坐得不远的徐光启，便说道：“徐阁老，你给毛大人和各位大人说说这顿饭的意思。”
说完也不管他们，忙着将自己碗里快凉的牛肉送进嘴里，一股辣味和牛肉劲爽传来，这味道真没得说；又吃了口红薯，味道还是差了点，但是没法啊！皇帝得做表率啊！要不怎么推广。
两口吃完一个，示意边上的曹化淳去装了碗白米饭，不在那红薯了。
徐光启听到吩咐，忙站起身行完礼道：“毛大人，您别看这几样普通物件，如今可能养活了多少大明子民？”
说着，他夹了快土豆，举起来说道：“各位大人，此物是西洋人从地球另一边的南美运过来的，叫土豆，也可以说洋芋头；这个产量高，不太需要水，适合在北方旱地方栽种，可以做为主食直接食用。”
又夹起块玉米，接着说道：“这个是玉米，和刚才陛下吃的红薯，这三样都是适合北方旱地的高产食物，今年已经在北京的皇庄获得大面积推广，明年准备在陕西、甘肃一带推广，这可比小米和小麦都高产啊！”
首辅没见过西红柿，便指着西红柿炒蛋问道：“徐阁老，请问此为何物？”
徐光启看着，有点尴尬道：“此物名为西红柿，也是那美洲植物，是那传教士带来的，本官看着红艳艳的喜气，便栽培了出来放在家里做盆景；一次陛下见到此物，大叫了声便摘下几个吃了，还说味道鲜美，最适合生吃或与鸡蛋炒着吃或打汤；本官也尝过，确如陛下所言。”
朱由检或许是故意配合表演，让曹化淳用勺子装了点西红柿，就着牛肉将一碗饭又吃的干干净净，然后将碗一伸，示意再来一碗。
朱由检吃得高兴，得意道：“你们啊！以为平时可以吃到这东西，美吧！快趁热吃了，朕准备建一个大的玻璃棚，在冬季种植蔬菜，到时看你们吃不吃，蔬菜的税好像不高哦！”
曹变蛟早饿了，看着其他人不动筷子，也不敢乱动；听到陛下的号令，忙把用勺扒了将近一半西红柿到碗里，又夹了几块牛肉美美吃了起来，几个武将一看，忙进行了无声的争斗中，几下将那碗西红柿炒蛋一空，不久又将目标对准了其它几碗菜。
那群文官则慢条斯理的品着、慢慢咽下，似乎在想这心思；在帝国的政治角逐中，文官落后了，他们中一些人好像有体会了。
一场别具一格的午餐就这么结束，适当休息后，继续开会。
最先定下来的是九边改制问题，会议最后还是决定取消九边各镇，结合五军都督府改制，在十月份中最后定制出来。
将军队边军改编为大明皇家陆军，禁军改编为大明皇家近卫军、殿前直军改为大明皇家卫队；设定了服役期限，除了专业军士和旅长以上可终生服役，其余服役期满可以选择退役；其中普通士兵服役年限调整为五年，自愿前提下可连续服役两个服役期，不得超过三个服役期。
宣大及三边总督区宁夏、固原、临洮、甘肃、大同、太原镇整编下来的除了一部分派往家乡担任基层管理人员、税丁及巡防营，其余约三万调往在河套地区改为皇家屯垦军团；余下两万人编成辎重军修建大同到集宁，榆林到鄂尔多斯到到九原的道路，回应了对归化总督区个蒙古部（现在是蒙古各卫）承诺。
蓟辽总督区整编下来的约三万人调往朵颜卫故地方改编辽西屯垦军团，余下两万人改编为辎重军，修建锦州到营州（现辽宁朝阳市）到赤峰（明大宁辖区）及密云、遵化到承德到赤峰到通辽的道路。
大明皇家陆军暂时编为三个军，即：镇西军、镇北军、镇东军；十二步兵镇、九个步兵镇，总人数三十一万两千人，其中：步兵十七万八千人，骑兵十三万四千人。
镇西军：军长徐应元，副军长候世禄、黄得功，军长驻地兰州；
下辖皇家陆军第二镇（甘肃镇）、第四镇（宁夏镇）、第六镇（固原、临洮镇，改驻西安），皇家陆军骑兵第一镇（禁军骑兵一镇），骑兵第三镇（附和浩特镇），骑兵第五镇（九原镇），骑兵第七镇（鄂尔多斯镇）等三镇步兵三万六千人，四镇骑兵四万八千人，合计八万四千人。
镇北军：军长杨国柱，副军长马世龙、何可纲，军驻地宁远，除陆军第一镇调大宁，第四镇调营州（朝阳市），其它驻地不变；
原宁远镇步兵与盖州镇整编改为四个镇，杨国柱兼第三镇总兵原总兵吴襄、调盖州镇旅长黄龙、担任其余两镇总兵，骑兵也改为两个镇，总兵分别为祖大寿、何可纲；
下辖：皇家陆军第一镇（蓟州镇）、第三镇（宁远镇杨国柱部）、第五镇（宁远镇吴襄部）、第七镇（宁远镇黄龙部）、第九镇（盖洲镇马世龙部）、第十一镇（山海镇），皇家陆军骑兵第二镇（宣大镇骑兵）、皇家骑兵第四镇（宁远镇祖大寿部）、皇家骑兵第六镇（宁元镇何可纲部）、皇家骑兵第八镇（蒙古归附通辽镇）、骑兵第十镇（蒙古归附长春镇）等五镇步兵七万两千人、五镇骑兵五万八千人，合计共十三万人。
镇东军,军长曹文诏、副军长孙祖寿、满桂，军长驻地南京，其它未变；
下辖皇家陆军第八镇(禁军第三镇)、第十镇（禁军第二镇）、第十二镇(禁军第六镇)、第十三镇（禁军第七镇）、第十四镇（禁军第八镇）及皇家骑兵第九镇（大同镇镇骑兵）等五镇步军八万人，一镇骑兵一万八人，合计共九万八千人。
皇家近卫军调整最大，那边各军全部划归皇家陆军，各镇主官调整也大，第一、三、四镇原总兵调走后，从下面各旅长提升姚忠明、孙华宝、许文畅（杜撰的）担任新的总兵。
最后整编为四镇步兵六万四千人、一镇骑兵兵四万人，合计十万四千人。
负责北京周边安全；军长梁世勋，荣誉军长朱由检，副军长周遇吉、毛文龙，军驻地北京；
下辖近卫第一镇（禁军第一镇）、近卫第二镇（禁军第四镇）、近卫第三镇（禁军第五镇），近卫第四镇（昌平、宣府镇步兵），禁军骑兵第一镇（禁军骑兵二镇），骑兵第二镇（集宁镇）。
这次更改军制三大总督区总共裁减十二万人，大大降低了军费负担。
同时三大总督区撤销，孙承宗任直隶总督辖辽东、直隶、山西等两省一边，成为第一督臣；孙传庭任江南总督，辖安徽、南直隶和浙江等三省，为第二督臣；洪承畴任陕甘总督，辖陕西和甘肃。
皇家卫队是名称改变，各卫都改编成甲等卫。
五军都督府的改革也落地，从皇家陆军、皇家近卫军、皇家卫队、东厂、锦衣卫、内宫各监及皇商抽调人员配合原有的合适组成了新的五军都督府，办公点从武英殿改到养心殿。
朱由检掌管大都督府，亲任大都督，大都督府成员有英国公张维贤、保定公梁世勋、内阁首辅李标、次辅李邦国、参谋本部督查卢象升。
下辖四部一处：参谋本部（督查卢象升）、军法本部（督查文震明）、辎重本部（督查陈治宁（王府白户））、装备本部（督查孙元化）。
秘书处，主要处理下面四个本部上报奏本，处长由王承恩担任。
朱由检终于打造了明朝版本军事委员会和总参谋部，大都督府是军事委员会，下辖四部就是总参谋部。
大都督府如同内阁需定期举行军政会议，内阁首辅、次辅及兵部需参加，其余各部视情况需要才会参加会议，到京述职的各军军长及总督均要参与会议。
随着五军都督府搬迁，内阁也将办公点从文华殿移到乾清宫左侧与奉先殿之间的德政殿，德政殿是由斋宫和周围部分建筑拆除和改建而成。
漕运总督府划归辎重本部管辖，运河沿线负责漕运的卫所兵被分成三块，熟悉水手业务的被抽调到北洋水师，一部分部分组建了内河水师负责运河漕运与长江水道安全，还有部分和山东、直隶、浙江的部分卫所兵被整编税丁调归户部管辖，剩下的老弱被送去个皇庄的集体农场安置。
各省设有五军都指挥司负责管辖本省巡防营，人数五千到两万不等，合计二十万人左右。
五军都指挥司主要职责是负责本省制安安全、剿匪、招兵及兵站等工作；各军设立专职参谋、军法、后勤等司，各镇设立参谋、军法、后勤等处。
整编完成，皇家近卫军驻地有稍微调整：近卫第一镇、第二镇驻扎北京，协助皇家卫队守卫京城，第三镇驻扎天津，第四镇驻扎宣府；骑兵一镇调山海关，骑兵二镇在集宁。
这次军制调整涉及的主要九边的边军和禁军体系，卫所体系尚未改革的还有四川、云南、贵州和广西四省，这四省还未做改制。
备注：
1、皇家陆军全部按原禁军模式整编，淘汰下来的武器装备巡防营、屯垦军、和长城沿线皇庄“自卫队”，余下部分准备出售給漠北蒙古及西域(现新疆)蒙古各部。
2、皇家陆军步兵镇中除由原禁军各镇改编的是三旅制约一万六千人，其余是两旅制约一万两千人；骑兵镇中第一、二、九镇为三旅制一万八千人外，其余各镇为两旅制约一万人。
3、此次整编主要是拆分辽东各镇的实力，各镇驻地如未说明即是未做调动。
4、四川、贵州两省的土司动乱——“奢安之乱”尚未完全平定，未做整编。